Pratama Persadha tidak jadi dilantik sebagai Wakil Kepala Badan Siber dan Sandi Negara (BSSN) pada Rabu (19/2/2025), menggantikan Letjen TNI (Purn) Nugroho Sulistyo Budi, yang hanya dilantik sebagai Kepala BSSN. Sebelumnya, Pratama Persadha telah bersiap untuk dilantik dan telah mengenakan pakaian lengkap di Istana Negara. Namun, setelah acara pelantikan, Kepala BSSN menyatakan bahwa Pratama Persadha tidak jadi dilantik dan keputusan tersebut merupakan hak prerogatif Presiden.
Pratama Persadha sendiri mengonfirmasi bahwa pelantikannya ditunda dan akan menunggu arahan dari Kepala BSSN dan Seskab. Meskipun telah menandatangani pakta integritas, Pratama Persadha tidak dilantik sebagai Wakil Kepala BSSN. Sebagai informasi tambahan, Presiden Prabowo juga melakukan reshuffle kabinet dengan melantik Prof Brian Yuliarto sebagai Menteri Pendidikan Tinggi, Sains, dan Teknologi, serta menghadiri beberapa pelantikan pejabat lainnya, dihadiri oleh Wakil Presiden Gibran Rakabuming Raka dan jajaran menteri Kabinet Merah Putih.
